O diretor de missões de Assassin’s Creed III, Philippe Bergeron, afirmou em entrevista que o game contaria com um “ambicioso” modo cooperativo, que foi cortado por não se encaixar com a trama geral do game. Segundo ele, jogadores poderiam invadir as campanhas de outros a qualquer momento e auxilia-los nas missões.

Tal função, porém, foi descartada por não ser adequado á temática geral do game. Segundo Bergeron, os encontros esporádicos e as histórias mutáveis não seriam possíveis com o tema das memórias dos ancestrais, criando um paradoxo temporal. Dessa forma, o modo multiplayer foi renegado exclusivamente a um extra, sem influência na trama central.

Rumores indicam que o modo cooperativo pode fazer uma aparição em Assassin’s Creed IV. A informação, porém, não foi confirmada pela Ubisoft, que também ainda está devendo as primeiras informações sobre o próximo game da série dos assassinos.